Fem hjälparbetare för Läkare utan gränser blir kidnappade av en terroristgrupp vid ebolacentret i Sierra Leone. I vansinnesflykt pressar kidnapparna sina jeepar genom öknen och attackeras av militären. Terroristledaren blir dödligt skadad. Kirurgen Martin Roeykens insjuknar längs vägen med hög feber. Hans unga kollega, Mette Gobanski, får ett ultimatum: Rädda terroristen eller dö. När de till slut hamnar i en skola i Algeriet förstår Mette att mardrömmen bara börjat. Hemma i Stockholm inser Martins dotter Bella att tidskriften hon jobbar för har koppling till den skadade terroristledaren. Hon gör allt hon kan för att förhindra katastrofen nere i Algeriet. Saharasyndromet är den tredje, fristående, boken i serien om kirurgen Martin Roeykens.